地处偏僻的神和田村，是一个人口严重流失、老龄化程度极高的村落。医生伊野治的到来为老人们解决了治病无门的烦恼，他和蔼可亲，医术高明，被当地人奉为神明，备受尊敬。从东京来此实习的年轻医师相马启介起初也不了解伊野甘于寂寞的做法，但随着出诊次数的增加，他和当地人建立了质朴的友情，也对伊野医生有了更多地了解。然而就在两个月后的某个夜晚，伊野医生神秘失踪，村民们慌乱不安，十分担心他的安危。而负责此案的警官却似乎另有想法，经过一系列的调查，关于伊野治的身份和秘密渐渐浮出水面……

本作于2017年12月16日公开的剧场版‘电影版妖怪手表：光影之卷 鬼王的复活’作为前导故事，后于2018年4月13日开始于东京电视台播放TV版的后续剧情。本作故事接续前作妖怪手表TV动画版的世界观，以30年后的樱花新城为舞台，描述夏芽一行人面临各种不可思议的灵异现象以及妖魔威胁，借由妖怪手表之力将之解决或击退。本作设定中妖怪们具有平时的“光型态”与战斗专用的“影型态”两种模样，使用的妖怪手表亦从“妖怪徽章”改为搭配“妖怪钥匙”