影片描述美籍华人张正奉中央情报局之命，前往中国大陆协助护送一件国宝赴美。他在武林圣地少林寺等候消息期间，跟少林寺方丈空智大师和七岁小和尚清淳产生了友谊，但也有文化差距与生活习惯的冲突。更令张正感到意外的，原来所谓的宝物是身怀特异功能的少女小菁，两人在揭破惊天阴谋的过程中产生了一段浪漫情缘。

清代末年，武风正盛，但他们却全然不知武学之道为何物。武当派的奇材白眉道人为了扬名立万，自创阴狠毒辣的武功，其掌门知道此事后，将他逐出武当。白眉在广州自立门户，开馆授徒，自创白眉派。 白眉前往少林挑战至善禅师，然至善对他的挑衅不理不睬，其师兄仰山不满白眉所为，私下应战，但却惨被打败，至善以他违反寺规为由将他逐出少林，白眉遂借此事羞辱少林。此时，少年武痴洪熙官孤身到少林寺找寻至善，拜师学艺，可惜被拒。然二人却由此而相识，至善听洪熙官之言下山，视察武林情况，二人开始踏足江湖。 一老一少南下投宿光孝寺，不少好武之

少林叛徒韩先生（石坚 饰）背叛少林后，斥资买下一座小岛将其改造成私人王国，韩先生及一干手下在岛上制贩毒品，强迫女性卖淫，警方欲将其绳之以法却苦无证据。少林高徒李（李小龙 饰）的功夫已经超越有形境界，他受师傅与政府请托，准备参加三年一度由韩先生主办的比武大会。比武大会期间，是登陆孤岛搜集证据的唯一机会。同时韩先生的私人保镖熬加达曾经杀害了李的姐姐，是李恨之入骨的仇人。比武大会的邀请发出，世界各地选手纷纷聚集，有债务缠身的鲁柏、勇于对抗不公的威廉士等人与李一同登岛决一雌雄。李找到了政府在岛上安插的情报员美玲，

李世民因屡立战功，被父王册封，统管兵权，遭到了太子妒忌，太子设计使李世民被郑国大将王仁则追杀，幸被村里行侠仗义的张宝拳和他的儿子小宝搭救，将他藏匿于山中。

乾隆三十八年间，少林叛徒高进忠率领清兵血洗少林。侥幸逃生的义士对高恨之入骨，誓杀奸贼以报冤仇。然几次复仇行动皆告失败，以洪熙官为首的一众义士避开清兵锋芒，前往广州创办了“琼花会馆”。但不久高进忠调任广州提督，来至此地，双方又是一场恶斗。另一方面，广州方姓之家有一公子，名叫世玉，他自幼随母习武，功夫了得，加上天性顽皮，少不得在外惹出祸端。广州恶霸雷老虎死在方世玉手下，雷的妻子李小环和丈人李巴山对世玉穷追不舍。危急时刻，奄奄一息的世玉遇见了正在逃避官府追杀的洪熙官

清朝康熙年间，少林俗家弟子洪熙官（李连杰饰）是红花会成员，力图反清复明。洪熙官因被同门师兄马宁儿（计春华饰）出卖，家人被叛徒杀害，幸得幼子文定（谢苗饰）避过大难，洪熙官将马宁儿刺死后与文定浪迹天涯。洪熙官父子和行骗的朱小倩和红豆母女碰到一起，闹出许多事情。少林遭劫难，至菩禅师将藏宝图纹在五个年幼的的俗家弟子背上，为防被朝廷夺走，并密函告知洪熙官，务必护送他们前往红花会。但马宁儿被洪熙官打成重伤后，并没有死，而是变成全身是毒、刀枪不入的怪物，他杀害了红花会总舵主，并追杀五个孩子……

少林哑徒弟（成龙 饰）为了报杀父之仇而学武，从挑水砍柴做起，苦熬内功基础，打出木人巷学成武功的情形时时出现在他的梦中，父亲被害的惨状和客居少林的五枚师太的开解令他在疲乏时咬紧牙关坚持。哑徒弟在少林禁地发现了被锁住的老怪人法愚，法愚不似少林僧人，但有感于哑徒弟的照顾，法愚指点尚不具备学习少林武术资格的哑徒弟武功，期间哑徒弟师兄闯入木人巷却实力不济铩羽而归。五枚师太见独自温习武功的哑徒弟出招狠辣，随传授蛇翼八步调理其心性，经法愚调教，哑徒弟成功打出木人巷，得以学成下山，法愚令其携带信物联络江湖帮派，引发江湖搏

隋朝末年，隋将王世充的侄子王仁则在督建河防工事时，杀死了起来反抗暴虐的神腿张，但令其儿子小虎子跳河逃离虎口。小虎子被少林僧人救起收入寺中后，为报父仇毅然削发为僧，法名“觉远”。王仁则的侍卫长遇见牧羊女白无瑕后垂涎其美色，强行将其抢回府并欲酒后施暴，恰巧被只身前来报仇的觉远发现。在救白无瑕逃生的过程中，觉远因武功欠佳被王仁则刺伤，促使其回到少林寺后更加刻苦练功。后因觉远救援被王仁则追赶的李世民，少林寺遭遇劫难，觉远身上的责任更重一层。

明朝中叶，皇帝年幼继位，太监王其自封“立皇帝”权倾朝野，与倭寇勾结，妄图篡位，大明江山岌岌可危。忠良之后徐子豪是京都总兵徐超之子，也是皇帝的伴读。徐子豪贪玩，无意间撞到太监王其送“秘密计划”给倭寇的武林高手。徐子豪把这件事告诉了父亲徐超。朝堂之上，徐超向皇帝弹劾王其，反被王其陷害，徐家满门抄斩。徐子豪进入少林寺避难。

金刚王（释延能 饰）和哥哥在年幼时被海盗从中国福建贩卖到位于日本的哈迪斯神社，接受残忍的搏杀训练。八年后，已经成为哈迪斯最顶级杀手的金刚王逃回中国，幸遇南少林宗师而成为一个爱国主义者，从事反抗日本侵略活动，几年后被南少林封为金刚王。在日本军方授意下，哈迪斯组织在福建南少林脚下的一座巨大的客家土楼内建立了中国哈迪斯金刚神社。他们设立暴坛、伤坛、绝坛三个搏击擂台，借此击杀和征服中国的武林高手以及中国远东军特战部队的各国战俘，并将战果通过世界媒体公诸于众，以此摧毁中国人民的抵抗意志。为救助陷入土楼的世界各界人士