本作品是超蛙战士系列3D电影的第2部，讲述的是一个发生在外太空的故事。由于人类太空探索而产生的两个派生人种，梯族人和蛙族人为了争夺领地和资源展开了旷日持久的战争，梯族黑死星等地资源各方面都出现匮乏，生存的欲望驱使他们对外扩张，在吞并了部分弱小星球后，梯族人开始将爪牙伸向实力相对强大的蛙族领地。在巫帝、利普顿等将领的主持下，梯族军队兵分两路，大举进攻湿地星球，首当其冲的便是赤峰坎。梯族人试图通过拿下蛙族核心领地，一举完成对蛙族人的侵略和掌控。梯族人的暴行引起了蛙族世界震惊。

一批年轻的舰员，首次登上最先进的星舰企业号，并将展开她的处女航。地球身处的银河系的命运掌控在两个出生于截然不同世界和背景的年轻人手中：其中一人是詹姆士·泰伯伦·寇克——来自地球美国爱荷华州乡下的野孩子，不爱读书，只爱寻找刺激和冒险，但是他却是一个天生的领导人物；另外一人则是史巴克——出生成长于瓦肯星，但却因为母亲是人类所以受到排挤，所以他对瓦肯星人一向都没有感情，不过他仍然是个用功聪明的学生，一个即将成为第一名考进星舰学院的瓦肯人。 　　寇克和史巴克的个性南辕北辙，但是在他们分别寻找自我和对世界有何贡献的

出生于瓦肯星的男孩史波克（扎克瑞·昆图 饰），因为母亲阿曼达·格雷森是人类，经常遭到同僚的嘲笑和欺负。父亲萨瑞克是瓦肯星的一名外交官，史波克从小就不断地在严肃的瓦肯逻辑教育和他的人类情感之间挣扎。长大后的史波克遇到了同样怀着远大志向的柯克（克里斯·派恩 饰），两人虽矛盾不断但通过种种任务考验逐渐开始互相理解。企业号的老舰长是克里斯托弗·派克，舰员则包括医疗官“老骨头”麦考伊、总工程师史考特、通讯官乌乎拉、舵手苏鲁，以及17岁的领航员——天才少年契柯夫。

该剧以中日甲午海战为背景,主人公不是历史上名声显要的人物,而是将关注的目光投向通过一群生活和战斗在“定远”舰上的水兵们,从小人物的角度反映出中华民族在大敌当前的危难时刻所表现出的无畏不惧,舍生取义的民族精神和爱国情操。

传说中只要得到分散在地球的12个超星神就能有统治全宇宙的力量。邪恶的“宇宙海盗”抢夺全部的超星神，统治着全宇宙。在强大的邪恶势力面前，为了收复密封舱而英勇作战的叛乱军，也一筹莫展。

某舰队两栖侦察兵正在训练场上练习格斗，雪亮的匕首和阵阵杀声吸引了舰队子弟学校的三个男孩。为首的董海星翻墙而过，企图窃取匕首，结果被一个海军军官“俘获”。次日，白鸥老师向五年级二班的同学介绍新来的辅导员梁驰涛，董海星认出他原来就是那个“仇敌”。一天晚上，熄灯号吹过之后，五（2）班的男生宿舍里依旧灯火通明，一场“海战”正在激烈地进行。辅导员梁驰涛来到了“战场”，严厉地批评了这些违纪的“水兵”，受到处罚的董海星对梁驰涛更加不满了。董海星、谢潜和金宝贝是“特混舰队”的领袖，并自封为“将军”。一天，他们在鲨鱼礁附近

一团硕大无朋的高能离子云，在遥远而神秘的太空中迅疾地飘移。这团能量云具有无坚不摧的威力，足以毁灭宇宙间任何物质结构。在它所划过的轨迹上，早已有好几艘分属银河三大势力的星舰遇难了……地球-银河系星球联邦的重镇，星际舰队总部的所在地。在位于北美洲旧金山的星际联邦舰队总部，寇克将军正像往常一样百无聊赖无所事事，突然间却接到了一个再好不过的命令检视企业号准备执行紧急任务。原来地球的防卫体系己经发现了那团高能离子云，而且侦测出它正对准地球飞来。寇克将军的任务，就是要赶在它到达地球之前，率领企业号先迎上去一探究竟。阔

三体人在利用科技锁死了地球人的科学之后，出动庞大的宇宙舰队直扑太阳系，意欲清除地球文明，面对地球文明前所未有的危局，人类组建起同样庞大的太空舰队，同时（PDC）利用三体人思维透明的致命缺陷，制订了“面壁计划”，精选出四位“面壁者”。而在危机纪元到来之前曾受到叶文洁的启示，并在随后提出“宇宙社会学”的罗辑在毫无准备的情况下被选入这四人之列，成为面壁者之一。虽然三体人自身无法识破人类的计谋，却依靠由地球人中的背叛者挑选出的“破壁人”与“面壁者”进行智慧博弈。在这场你死我活的文明生存竞争中，罗辑由一开始的逃避和

400万年前，为了逃离战乱连年的塞博坦星，被称为“微型金刚”的小型变形金刚种族驾驶宇宙船飞离了星球，然而，他们的太空船穿越时空之后，却坠落在地球上。 400万年后，一位名为雷德的地球少年和同学们不经意在太空船中发现了其中一架微型金刚，微型金刚复活的讯号也在同时传到了汽车人和霸天虎手上，为了争夺微型金刚，两军前往地球，并且继续在塞博坦星的战争......