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21世纪初，人类将多数人留在被哥斯拉蹂躏的地球上，仅使被选中的人们乘上恒星间移民船·阿拉特拉姆，前往能够移居的“约定之地·τ星e”。但这一计划失败，人类只得再度返回地球。而长距离亚空间航行所引发的时空歪曲，导致人类回到的地方变成了“两万年后的地球”。在这个地球，主人公·晴男等人在遭受哥斯拉袭击的同时，与埃克西弗、比尔沙尔德两种族的异星人共同实行谋划了20年的“对哥斯拉战术”，通过殊死战斗成功击倒了哥斯拉。

房地产公司工作的林静儿，受命去跟飞龙地产公司柳公子谈合作。在停车场，彦龙和林静儿不打不相识，给彼此留下不好的印象。而后，林静儿在跟一家地产公司谈合作时，险些被地产公司的柳公子劫色，幸亏柳公子的朋友彦龙出手相助。由于项目没有谈成，林静儿被公司开除，却意外得到了彦龙的赏识，以百万年薪出任彦龙地产公司项目经理一职，林静儿也为了能有钱给父亲治病，答应了彦龙的邀请。林静儿刚进公司时，受到了许多老员工的刁难，其中彦龙的女秘书张凤一直仰慕彦龙，更是找机会处处刁难林静儿。林静儿忍受所有来自公司员工的刁难，彦龙得知这件事后