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2048年，灵云系统作为“智能脑大众化应用”的首例，在蜃泉市城市范围内试用。当日灵云系统发布会的事故引发了其创始人周童，赵飞白以及儿时挚友阿依古丽，艾孜买提之间的理念情感纠葛。为达成自己的目的，周童将赵飞白，阿依古丽和艾孜买提的“脑意识”被封闭在灵云系统内的沙盒空间，却无意间触发了系统的“初始智能AI”------露可可的启动。一切皆联系于当年四人记忆中的“印迹”游戏，一场以“人心羁绊”为代码的智能危机在现实和虚拟世界之间展开。

亚当,一个十三岁的、不合群的男孩,为了发现父亲失踪背后的秘密,踏上了一段惊心动魄、令人难忘的征程。他很快发现他的父亲正是传说中的大脚怪,他多年来一直躲藏在森林里,以保护他自己和家人不被大型公司 HairCo. 纠缠。该公司渴望用他的特殊 DNA 进行科学实验。就当这对父子开始弥补失去的时光时,亚当很快发现自己也赋有超乎想象的超能力。但他们不知道的是,HairCo. 正沿着亚当留下的踪迹紧追过来......

高一那年夏天，帆高离开位在离岛的家乡，独自一人来到东京，拮据的生活迫使他不得不找份工作，最后来到一间专门出版奇怪超自然刊物的出版社担任写手。不久，东京开始下起连日大雨，仿佛暗示着帆高不顺遂的未来，在这座繁忙城市里到处取材的帆高邂逅了与弟弟相依为命，不可思议的美少女阳菜。「等等就会放晴了喔。」阳菜这样告诉着帆高，不久，头顶的乌云逐渐散去，耀眼的阳光洒落街道……原来，阳菜拥有「改变天气」的奇妙能力……