故事发生在桃园高中之内，加贺良介（下野紘 配音）是学校里出了名的好色之徒，对美少女的一切都十分热衷。某日，良介偶遇了名为丽萨菈（远藤绫 配音）的神秘女子，其真实身份竟是出身名门的死神，在阴差阳错之下，良介和丽萨菈签订了契约，他所要付出的代价竟然是他的色欲之魂。大仓美菜（石原夏织 配音）是良介青梅竹马的玩伴，美菜内心里一直喜欢着善良的良介，然而却选择将这份感情深深的埋藏在心底。丽萨菈的妹妹裘儿（西口杏里沙 配音）亦身处人间界，一心想要打败姐姐取而代之的她却最终成为了失败者因此丧失了魔力，于是，裘儿和美菜签订了契约，就此，一段复杂的四人关系拉开了序幕。
1998年夏季，拥有预测型未来视的女孩濑尾静音（井口裕香 配音）邂逅伽蓝之堂的黑桐干也（铃村健一 配音）。从对方口中，她了解到未来视的真相，心中的疑惑和焦虑也烟消云散，但同时也看到了干也悲剧性的未来。另一方面，拥有测定型未来视的职业炸弹狂魔仓密目琉夏，利用自己构建的未来制造一系列恐怖袭击事件，直到他遭遇冷静干练的两仪式（坂本真绫 配音），命运的齿轮开始转动。转眼来到2010年，失去了未来视能力的瓶仓光瑠（石田彰 配音）转行做了绘本画家，命运安排他和两仪式及其女儿未那（金元寿子 配音）相逢，此后他和崇拜自己的未那拜访了传奇占卜师观布子之母…… 本片根据奈须蘑菇以及武内崇创作的同名原作改编。
TV第54话再编集版。
终于，河野亨（福山润 配音）进入了他梦寐以求的私立贵族男校“藤森学园”，然而刚刚进入学校，就传来了一个噩耗：面容清秀的他居然被选为了“公主”候补生！所谓的“公主”制度，就是由相貌姣好的男生穿上各种华丽的洋服，化妆成可爱的女性来活跃单调的校园气氛。河野亨的第一反应即是拒绝，但当他得知成为“公主”不仅能够享受诸多福利和特权，还能得到一部分的分红时，他的决心动摇了。 在学园里，他遇见了另外两位“公主”：有着完美外表，在男性和“公主”的身份中变换自如的四方谷裕史郎（朴璐美 配音），以及性格温顺同时又十分害羞的丰实琴（柿原彻也 配音）。这性格迥异的三人，为了完成自己做为“公主”的使命，在抗拒与顺从中展开了一段欢乐的校园生活。
作品设定是如果按下按钮，就可以得到100万日元，但是作为代价，必须在空空荡荡的空间里度过5亿年，5亿年结束后会失去这段时间的记忆。故事就是围绕着这个5亿年按钮展开的。动画讲述了因付不起住院的父亲的治疗费而走投无路的5岁的托尼奥、14岁的子美、17岁的小奈子三姐弟面前，出现了一个拿着5亿年按钮的人物，故事由此展开。
失去亲人的痛苦让九路敬一郎（柿原彻也 配音）丧失了生活的热情，热爱音乐的他已经很久没有碰过那把曾经珍爱的吉他了。一天，敬一郎在垃圾堆里看到了一个少女模样的机器人，她的名字叫小花（浅野真澄 配音）。因为型号过去老旧，小花被曾经的主人残忍的抛弃了。在这个夏天，这个雨季，小花和敬一郎相遇了，一段传奇般的缘分开始运转。 为了使消沉的敬一郎振作起来，个性有些迷糊的小花学习起了唱歌，可是，越来越频繁的机能中断使小花一次又一次的失去了意识。在弥留之际，敬一郎带小花来到了她梦寐以求的海边，望着蔚蓝的大海和身边的朋友，小花的口中，竟然哼唱起了敬一郎所谱写的乐曲。小花离开了，但取而代之的是一枚用她的核心所制成的八音盒，小花的歌声，将永远陪伴在敬一郎的左右。
神崎堇因为灵力丧失决定退出花组，回到神崎重工。
在一所高中内，生活着一群性格怪怪的男孩女孩。故事的主角之一朝仓（中本顺久 配音），蓬蓬头，忽闪着一双充满幻想的大眼睛。出于某种不良的渴望，他希望将来能成为教师，然而他的成绩却糟糕透顶。眼神凶恶的石田（森嶋秀太 配音）与朝仓是从小学时代便过从甚密的好朋友，他深深爱着朝仓，最大的愿望是毕业后和好友一同经营花店。不过石田面临着各种各样的“情敌”，如长着超长大暴牙梦想和朝仓开书店的山田（樱井透 配音），身材最合朝仓胃口的同班女生佐藤（中野さいま 配音）。怪人一箩筐，凑在一起惹出无数好笑、脱力的小故事…… 本片根据正雄的同名漫画改编。
『#13' 炎天下の撮影モデルも楽じゃありませんわね。』が、2010年7月24日発売の『とある科学の超電磁砲 OFFICIAL VISUAL BOOK』付属DVDに収録された。テレビアニメ第1期第13話と平行したオリジナル短編エピソードである。
